Ответ:

«Нависшая над высокими вершинами тополей» — причастный оборот после определяемого слова «туча». Поэтому он выделяется запятыми на границах оборота: после слова «туча» и после слова «тополей». Перед дополнением «моросящим дождиком» запятая не требуется.

Ответ: 1, 3.