В первой части предложения используется Present Simple, так как это описание характера (она очень добрая девушка). Во второй части, 'I don't understand' — это общее мнение, поэтому Present Simple. 'why she is so mean now' — это описание поведения в данный момент, поэтому Present Simple.
Ответ: is, don't understand, is