Ответ:

Семена, полностью покрытые водой, лишились доступа к воздуху. Для прорастания семенам нужен кислород: он необходим им для дыхания. Без достаточного количества кислорода семена не смогли нормально развиваться и испортились.

Ответ: семена лишились кислорода из воздуха, необходимого для дыхания и прорастания.