Ответ:

У могилы отца Дуню, вероятно, переполняли скорбь, раскаяние и чувство вины. Она могла горько плакать о том, что оставила отца одного и уехала с Минским, не подумав, как тяжело тот переживёт разлуку.

Можно предположить, что Дуня молила отца простить её за отъезд и за долгие годы, проведённые вдали от него. В повести прямо не сказано, о чём она молилась: это вывод по её поведению у могилы.