Ответ:

Между частями сложного предложения с разными грамматическими основами ставится запятая.

  1. а) За озером над лесом стояла тёмно-синяя туча. Основа: «туча стояла». Это простое предложение.
  2. б) Солнце уже закатилось, и теперь из-за каждого дерева выглядывала темнота. Основы: «солнце закатилось» и «темнота выглядывала».
  3. в) Над кувшинками летали лёгкие стрекозы, а в небе кружили ласточки. Основы: «стрекозы летали» и «ласточки кружили».

Ответ: простое предложение — а).