2. В статье было написано, чтобы люди не считали ненужными (они) и даже вредными для (они) мухоморы, но пора (мы) перестать мерить природу по себе.

Подставим местоимения в нужной форме.

1. считали ненужными им — дательный падеж;
2. вредными для них — родительный падеж после предлога «для»;
3. пора нам перестать — дательный падеж.

В статье было написано, чтобы люди не считали ненужными им и даже вредными для них мухоморы, но пора нам перестать мерить природу по себе.

Ответ: им, них, нам.