Ответ:

  1. Началась гроза, молния ударила в старый дуб. Запятая разделяет части сложного предложения: основы «гроза началась» и «молния ударила».
  2. В сентябре мы посадили в саду яблони и груши. Предложение простое; «яблони и груши» — однородные дополнения, поэтому запятая перед одиночным союзом «и» не ставится.
  3. Стрижи охотятся высоко в воздухе, а жаворонки вьют гнёзда близко к земле. Запятая ставится перед союзом «а» между частями сложного предложения: основы «стрижи охотятся» и «жаворонки вьют».

Сложные предложения: первое и третье.