Ответ:

Части сложного предложения перед союзом «а» разделяются запятыми (2 и 6). Запятая (3) разделяет однородные члены «заводской архив» и «лаборатория». В остальных отмеченных местах запятые не нужны: определения «каменный дом» и «башню-колокольню с девятью мини-этажами» не обособляются.

Ответ: 2, 3, 6.