Изначально башкиры отнеслись к идее построения Оренбурга и других крепостей неоднозначно, а порой и враждебно. Строительство новых укреплений и расширение границ империи на их территориях воспринималось как угроза их традиционному укладу жизни, землям и свободе. Это приводило к сопротивлению и восстаниям, в которых башкиры активно участвовали. Однако, со временем, часть башкирского населения стала лояльнее относиться к Российской империи, в том числе и к новым крепостям, что было результатом как политики правительства, так и осознания преимуществ интеграции.