Ответ:

Пары слов с одинаковой транскрипцией:

  1. луг — лук: [лук];
  2. плод — плот: [плот];
  3. бал — балл: [бал];
  4. гриб — грипп: [грип];
  5. кот — код: [кот];
  6. полки (доски) — полки (воинские части): [полк’и].

Слова му́ка — мука́ и а́тлас — атла́с имеют разное ударение, поэтому их транскрипции не одинаковы.

Ответ: луг — лук; плод — плот; бал — балл; гриб — грипп; кот — код; полки — полки.