Ответ:

Выровняем числа по разрядам и выполним вычитание в двоичной системе:

  1001
- 0011
──────
  0110

Начальный ноль в результате можно опустить: 0110₂ = 110₂. Проверка: 1001₂ = 9₁₀, 11₂ = 3₁₀, и 9 − 3 = 6 = 110₂.

Ответ: 110₂.