Скелет млекопитающих состоит из черепа, позвоночника, поясов конечностей и самих конечностей.
Для млекопитающих характерна диафрагма — куполообразная дыхательная мышца. При её сокращении объём грудной полости увеличивается, а при расслаблении — уменьшается, наоборот.
Органы выделения млекопитающих — это пара почек, располагающихся в брюшной полости.
Сердце состоит из двух предсердий и двух желудочков. При движении по телу кровь проходит два круга: большой круг — от левого желудочка сердца по всему телу до правого предсердия; малый круг — от правого желудочка через лёгкие до левого предсердия.
Млекопитающие отличаются наиболее прогрессивным развитием головного мозга, в частности, в нём развилась кора больших полушарий, имеющая большое количество извилин благодаря которым увеличивается площадь мозга.
Зародыш млекопитающих развивается в матке, где он хорошо защищён от воздействия факторов окружающей среды.