Отец — вице-губернатор Никифор Михайлович Марин, участник Семилетней и турецких войн.
Аполлон Никифорович учился в 1-м кадетском корпусе, служил в лейб-гвардии Финляндском батальоне.
Участник Отечественной войны 1812 г. и Заграничного похода русской армии.
Был ранен под Бородином и при Лейпциге.
Награждён орденами Св. Анны и Св. Владимира.
Во время Польского восстания (1830-1831 гг.) был главнокомандующим войсками и гражданской частью города Лепеля.
Отличился при защите крепости Кейданы, награждён орденом Св. Георгия.
В 1834 г. произведён в генерал-майоры, затем в генерал-лейтенанты.
Занимал должность коменданта города Гродно.
Был членом комитета государственного коннозаводства.
Переехал в Санкт-Петербург.
Уволен в отставку.
Проживал в своём имении под Воронежем, где устроил школу для крестьянских мальчиков.
Автор истории Финляндского полка и сборника стихов «Песни и рассказы из военных походов».
Написал книгу «Русские богатыри — заветная книжка для ратных людей и народа русского», описывающую ход Отечественной войны 1812 г. и Заграничного похода.