Это общий вопрос о наличии (где находится) вашего брата. Используется глагол 'to be' в Present Simple. Для 3-го лица ед. ч. (your brother) используется 'Is'.
'Is' — форма глагола 'to be' для 3-го лица ед. ч., подходит.
'Does' — вспомогательный глагол, не используется здесь.
'Are' — форма для множественного числа, не подходит.