Ответ:

Пусть во второй коробке \(x\) карандашей. Тогда в первой — \(x+100\), а в третьей — \(2(x+100)\).

Составим уравнение по общему количеству карандашей:

\(x+(x+100)+2(x+100)=3900\).

\(4x+300=3900\),
\(4x=3600\),
\(x=900\).

В первой коробке: \(900+100=1000\) карандашей.

В третьей коробке: \(2\cdot1000=2000\) карандашей.

Проверка: \(900+1000+2000=3900\).

Ответ: во второй коробке 900 карандашей, в первой — 1000, в третьей — 2000.