Да, условия обитания значительно отличаются.
Естественный биогеоценоз характеризуется высоким видовым разнообразием, сложными пищевыми цепями, естественным круговоротом веществ и относительной устойчивостью.
Агроценоз (например, поле или сад) имеет низкое видовое разнообразие (преобладают культурные растения), упрощенные пищевые цепи, часто требует вмешательства человека (полив, удобрения, борьба с вредителями) и менее устойчив.