А чума, возбудителем которой является так называемая палочка Коха, была страшным бедствием в Средние века.

Решение:

Текст содержит несоответствие. Возбудителем чумы является бактерия Yersinia pestis, а не палочка Коха. Палочка Коха является возбудителем туберкулёза.

Несоответствие: А чума, возбудителем которой является так называемая палочка Коха

Исправление: А чума, возбудителем которой является Yersinia pestis