Утверждается, что Лиза усердно училась прошлой ночью, когда я ей позвонил. Действие происходило в прошлом, используем Past Continuous, т.к. это был процесс в определенный момент в прошлом. Правильный вариант: is studying.
Перевод: Лиза усердно занималась прошлым вечером, когда я ей позвонил.