4. А ведьма между тем поднялась так высоко что одним только черным пятнышком мелькала вверху.

Выполним задание по пунктуации и грамматике, следуя Протоколу Б и Протоколу Я.

1. Предложение со знаками препинания:

   А ведьма между тем поднялась так высоко, что одним только черным пятнышком мелькала вверху.

2. Объяснение расстановки знаков препинания:

   В предложении одна запятая, так как это сложноподчинённое предложение (СПП), где придаточная часть (что одним только черным пятнышком мелькала вверху) присоединяется к главной части (А ведьма между тем поднялась так высоко) с помощью союза что.

3. Грамматическая основа:

   Ведьма поднялась; пятнышком мелькала.

Ответ: А ведьма между тем поднялась так высоко, что одним только черным пятнышком мелькала вверху.