Ответ:

Перевод задания: Хотя солнце светило, всё ещё было холодно, потому что дождь шёл сильно в течение двух часов.

1) had been raining (шёл). Past Perfect Continuous подчёркивает длительность действия, которое происходило до момента в прошлом, описанного как it was still cold.

Ответ: 1) had been raining.