1) "сел на поваленное дерево ветром" — нормативно "сел на поваленное ветром дерево". Нарушение есть.
2) "поражала ясность взглядов" — нормативно "поражала ясность взглядов". Нарушения нет.
3) "не только была заметна тревога, но и ожидание" — нормативно "не только тревога, но и ожидание были заметны". Нарушение есть.
4) "который находится в центре города" — нормативно "который идёт в центре города". Нарушения нет.
5) "Прочитав рукопись, мне стало понятно, что она не лишена недостатков" — нормативно "Прочитав рукопись, я понял, что она не лишена недостатков". Нарушения нет.