Чтобы ответить на вопрос, что Алексу понравилось больше всего, обратимся к тексту: "My favourite part was the Vatican Museums."
Из текста следует, что больше всего Алексу понравились Музеи Ватикана.
Следовательно, верный ответ под номером 2.
Ответ: 2. The Vatican Museums.