Ex-2. Choose the correct answer: 1.Sorry we are late, we had missed/missed the bus.
Если в предложении есть указание на то, что одно действие произошло раньше другого ("we are late", то есть сейчас мы опоздали, а пропустили автобус раньше, чем опоздали), то для обозначения более раннего действия используется Past Perfect (had + V3).
Ответ: Sorry we are late, we had missed the bus.