Ответ:

В предложении «Туда, где хорошо ему будет» запятая отделяет придаточную часть от главной. Остальные знаки препинания соответствуют структуре диалога.

— Что это?

— Сам не знаю. Летит кто-то.

— Куда ж он летит?

— Туда, где хорошо ему будет.

Ответ: знаки препинания расставлены верно.