В данной ситуации администрация должна поступить следующим образом:
Обоснование:
Администрация проверила факт проведения работ и установила, что они ведутся без разрешения. Застройщик утверждает, что разрешение есть от другой инстанции. Для принятия законного решения необходимо подтвердить наличие такого разрешения. Самостоятельно принимать решение об отсутствии нарушения закона или выносить предписание без проверки всех обстоятельств будет некорректным. Поэтому правильным действием будет запрос подтверждения разрешения и ожидание ответа.
Ответ: Обратиться в городской департамент строительства с запросом о подтверждении выданного разрешения на проведение работ в ночное время и ожидать ответ.