I вариант. Мальчик спал, и по его измученному лицу судорожно пробегали отражения кошмаров, которые преследовали мальчика во сне.

В предложении три грамматические основы: «мальчик спал», «отражения пробегали», «которые преследовали». Между первыми двумя частями сложносочинённого предложения ставится запятая перед союзом «и». Придаточная определительная часть «которые преследовали мальчика во сне» отделяется запятой.