Согласно условию, инспектор обнаружил расхождение в данных декларации по НДС. Система, предназначенная для контроля за возмещением налога на добавленную стоимость, является АСК НДС-3. Эта система автоматизирована и предназначена для выявления подобных расхождений.
Следовательно, расхождение было выявлено Автоматизированной системой контроля за возмещением налога на добавленную стоимость (АСК НДС-3).
Ответ: Автоматизированной системой контроля за возмещением налога на добавленную стоимость (АСК НДС-3).