Да, смысл предложений изменится при изменении порядка слов, так как изменится субъект и объект действия:
Дуб заслоняет ель. (Дуб - субъект, ель - объект). В этом предложении акцент на том, что дуб больше и закрывает ель.
Ель заслоняет дуб. (Ель - субъект, дуб - объект). В этом предложении ель, наоборот, закрывает дуб, возможно, она выросла больше дуба.
Мать любит дочь. (Мать - субъект, дочь - объект). Это традиционная картина любви между матерью и дочерью, где мать проявляет заботу.
Дочь любит мать. (Дочь - субъект, мать - объект). Здесь акцент на любви и заботе дочери о своей матери, что может говорить об их близких отношениях или о том, что мать нуждается в заботе.
Ветер колышет тростник. (Ветер - субъект, тростник - объект). Ветер является причиной движения тростника.
Тростник колышет ветер. (Тростник - субъект, ветер - объект). Такое предложение звучит странно и может использоваться в переносном смысле, например, когда говорят о том, что тростник, качаясь, создает иллюзию движения ветра, или как метафора влияния чего-то слабого на что-то сильное.