Да, выделяют.
Водные растения, как и наземные, осуществляют фотосинтез. В процессе фотосинтеза они поглощают углекислый газ (который растворен в воде) и выделяют кислород. Этот кислород обогащает воду, что очень важно для жизни многих водных обитателей.