Какие из этих фразеологизмов могут употребляться в речи как свободные словосочетания (в прямом значении)?

Фразеологизмы - это устойчивые выражения, которые обычно используются в переносном смысле. Чтобы определить, какие из них могут употребляться в прямом значении, нужно рассмотреть каждый из них:

* Заклятый враг - это фразеологизм, обозначающий непримиримого врага. В прямом значении не употребляется.
* Бить баклуши - означает бездельничать. В прямом значении сейчас почти не употребляется, хотя исторически это обозначало раскалывание дерева на заготовки для ложек.
* Набрать в рот воды - означает молчать, уклоняться от ответа. В прямом значении может употребляться, но редко.
* Сматывать удочки - означает уходить, прекращать какое-либо дело. В прямом значении вполне употребимо.
* Зарубить на носу - означает запомнить крепко-накрепко. В прямом значении не употребляется.
* Намылить шею - означает отругать, наказать. В прямом значении может употребляться, но сейчас это скорее шутливое выражение.

Таким образом, наиболее подходящий вариант - это сматывать удочки, так как он вполне употребим в прямом значении. Также, с некоторой оговоркой, можно сказать про набрать в рот воды и намылить шею, так как теоретически их можно представить в прямом значении, хотя и звучит это необычно.