Может ли Государственная Дума в этом случае принять проект закона?

Решение:

В соответствии с Регламентом Государственной Думы, отрицательное заключение Правительства РФ на законопроект, предусматривающий увеличение расходов из федерального бюджета, не является препятствием для рассмотрения законопроекта Государственной Думой и его принятия.

Таким образом, Государственная Дума может принять проект закона.

Правильный вариант: Если Правительством представлено отрицательное заключение, то это не является препятствием для рассмотрения законопроекта Государственной Думой и его принятия.