На основании чего можно утверждать, что свойства, выявленные при исследовании модели некоторого объекта, присущи и самому оригиналу?

Это можно утверждать, если модель адекватна оригиналу именно в тех свойствах и связях, которые исследуются. Иными словами, для поставленной цели модель должна достаточно точно сохранять существенные характеристики объекта. Такой вывод не обязательно распространяется на свойства, которые модель не отражает.