Одна из групп министерств и ведомств осуществляет контроль и … за правильным, рациональным использованием природных ресурсов и охраной окружающей среды.

Пропущенное слово: надзор. В полном виде: «осуществляет контроль и надзор за правильным, рациональным использованием природных ресурсов и охраной окружающей среды».