3. Он стоял в углу комнаты в брюках, но в нижней рубахе, (1) и к рубахе были приколоты ордена, (2) и иногда эти ордена, цепляясь друг за дружку, издавали лёгкий звон.

Определим, какие пунктуационные правила действуют в данном предложении:

1. Перед союзом и в сложносочиненном предложении ставится запятая, если он соединяет два простых предложения в составе сложного. В данном случае, союз и соединяет два предложения: Он стоял в углу комнаты в брюках, но в нижней рубахе и к рубахе были приколоты ордена. Запятая нужна.
2. Перед союзом и в сложносочиненном предложении ставится запятая, если он соединяет два простых предложения в составе сложного. В данном случае, союз и соединяет два предложения: к рубахе были приколоты ордена и иногда эти ордена, цепляясь друг за дружку, издавали лёгкий звон. Запятая нужна.

Таким образом, на месте обеих цифр нужна запятая.