Да, интонации этих стихотворений отличаются. В стихотворении «Низкий дом с голубыми ставнями...» интонация более приземлённая, спокойная и, возможно, с оттенком лёгкой грусти, но без той выраженной тоски, как в «Я покинул родимый дом...». Первое стихотворение больше напоминает констатацию факта, описания, а второе — душевное переживание и воспоминание. Интонации в «Низкий дом...» могут быть более ровными, без ярко выраженных эмоциональных колебаний.