Высшим правительственным учреждением в годы правления Петра I был Правительствующий Сенат.
**Ответ: 4) Правительствующий Сенат**
**Объяснение:** Правительствующий Сенат был создан Петром I в 1711 году и выполнял функции высшего органа управления в отсутствие царя. Он занимался законодательством, управлением и судом.