Отличия отдела Голосеменные от отдела Папоротниковые:
- Голосеменные размножаются семенами, которые лежат открыто на чешуях шишек, а папоротники размножаются спорами, которые развиваются в спорангиях на нижней стороне листьев (вай).
- У голосеменных есть настоящие корни, стебли и листья, часто видоизмененные в хвою. У папоротников корневище с придаточными корнями и листья (вайи), стебля нет.
- Голосеменные - это в основном деревья и кустарники, а папоротники - в основном травянистые растения.