Для решения данной задачи необходимо проанализировать предоставленную информацию.
Исходя из этих данных, последним городом, попавшим в список дважды, является город Йошкар-Ола, так как это столица республики Марий Эл, население которой составляет около 300 тысяч человек. Этот город является административным центром своего субъекта и попадает под условия задачи. Столица Марий Эл является административным центром и в перечне городов России встречается дважды.
Ответ: Йошкар-Ола.