При каждом раунде репликации ДНК полимераза вносит ошибки в последовательность нуклеотидов. Чем раньше существовал общий предок двух видов, тем больше различий (нуклеотидных замен) накапливается между последовательностями ДНК потомков этого предка. Филогенетические деревья позволяют продемонстрировать эволюционную связь между потомками общего предка. Ниже приведено выравнивание последовательностей смысловых цепей гомологичных участков одного из генов трёх штаммов бактерии и их известного общего предка. Изменённые нуклеотиды в выравнивании выделены полужирным шрифтом. Предок: 5′-[последовательность на изображении читается не полностью]−3′; штамм A: 5′-[последовательность на изображении читается не полностью]−3′; штамм B: 5′-[последовательность на изображении читается не полностью]−3′; штамм C: 5′-[последовательность на изображении читается не полностью]−3′. Постройте филогенетическое древо для данных трёх штаммов на основании представленных последовательностей нуклеотидов. Укажите порядок возникновения трёх штаммов. Рассчитайте, когда существовал последний общий предок штаммов B и C при условии, что на приведённом участке за сто поколений возникает три нейтральных мутации. Приведите расчёты, аргументируя ответ. Считайте, что одно поколение у данного вида бактерий сменяется за 20 минут, а также, что все мутации, которые произошли в данном участке гена, нейтральные. При ответе округляйте значения до первого знака после запятой. Нейтральные мутации — это изменения в последовательности ДНК, которые не оказывают никакого влияния на приспособленность организма.

Последовательности нуклеотидов на фотографии недостаточно чёткие для надёжного распознавания. Поэтому нельзя достоверно посчитать различия между предком и каждым штаммом, определить ветвление дерева и вычислить время существования общего предка B и C. Подстановка предположительных нуклеотидов привела бы к ненадёжному результату.

Для выполнения задания нужен чёткий снимок участка с четырьмя строками выравнивания либо точная запись последовательностей предка и штаммов A, B и C. После этого число различий можно сопоставить с заданной скоростью мутаций: на 100 поколений приходится 3 мутации, а одно поколение длится 20 минут.