Ответ:

Прокурор вправе полностью или частично отказаться от поддержания государственного обвинения, если в ходе судебного разбирательства придёт к убеждению, что предъявленное обвинение не подтверждается доказательствами.

Такой отказ не требует согласования с вышестоящим прокурором. Поэтому частичный отказ от обвинения в описанной ситуации является законным.

Ответ: 1) Прокурор поступил законно, у прокурора есть право отказаться от обвинения в части.