Птицы имеют полые кости, облегчающие полет, тогда как у пресмыкающихся кости сплошные.
У птиц развит киль грудины для прикрепления летательных мышц, отсутствующий у пресмыкающихся.
Сердце птиц четырехкамерное с полной перегородкой, обеспечивающее полное разделение артериальной и венозной крови, в то время как у пресмыкающихся сердце трехкамерное с неполной перегородкой (кроме крокодилов).