Ответ:

Перевод задания: Она ... ясно дала понять, что не хочет идти.

Подходит made: это завершённое действие в прошлом. В конструкции make it clear означает «дать ясно понять».

She made it clear she didn’t want to go. (Она ясно дала понять, что не хочет идти.)

Варианты makes и is making относятся к настоящему времени, а had made обычно требует другого события в прошлом, относительно которого действие произошло раньше.