She said (that) she had been to Australia three times.

Предложение составлено правильно.

Перевод: Она сказала, что была в Австралии три раза.

В придаточном предложении используется Past Perfect — had been, поскольку это действие произошло раньше другого действия в прошлом (said).

Ответ: She said (that) she had been to Australia three times.