(she/come) home late last night?

Краткое пояснение: Так как в вопросе есть указание на время совершения действия (last night), то есть «прошлой ночью», используем Past Simple (простое прошедшее время). Вспомогательный глагол для образования вопросительной формы в Past Simple с местоимением she — did. Основной глагол come ставим в первую форму.