Хлорелла является эукариотической клеткой, в то время как бактерии – это прокариоты. Главное отличие состоит в наличии у хлореллы оформленного ядра и мембранных органелл (например, хлоропластов), в то время как у бактерий нет ядра и мембранные органеллы отсутствуют.