Ответ:

Природный газ добывают из самостоятельных газовых месторождений; его широко используют как топливо в энергетике, промышленности и быту, а также как сырьё для химической промышленности. Попутный газ получают вместе с нефтью. Его отделяют при подготовке нефти и используют как топливо и химическое сырьё; если его не утилизируют, он может сжигаться на факелах.

Ответ: различие прежде всего в происхождении: природный газ добывают из газовых залежей, а попутный получают при добыче нефти; способы дальнейшего использования во многом сходны.