Ответ:

1. Если от общего количества убрать 12 конфет, на которые во второй коробке больше, останется удвоенное количество конфет в первой: 90 − 12 = 78.

2. В первой коробке: 78 : 2 = 39 конфет.

3. Во второй коробке: 39 + 12 = 51 конфета.

Проверка: 39 + 51 = 90.

Ответ: в первой коробке 39 конфет, во второй — 51 конфета.