3) Дважды в год лета (не) бывает.
4) Он (не) доумевал.
В третьем предложении «не бывает» пишется раздельно, так как «бывает» это глагол.
В четвёртом предложении «не доумевал» пишется слитно, так как глагол «доумевать» без «не» не употребляется. «Недоумевать» - это целое слово с собственным значением.