Разберём предложение по частям:
темнело(1) и (2): Здесь союз и соединяет однородные сказуемые (темнело и когда темнело, но второе сказуемое опущено, что приводит к обособлению). Однако, в данном контексте, и соединяет обстоятельство времени (поздней осенью) с описанием состояния (очень быстро темнело) и придаточным времени (когда сумерки...). Запятая перед и не ставится, так как оно соединяет части сложноподчинённого предложения, где первая часть — главное предложение, а вторая — придаточное обстоятельственное времени.небом (3)то: Перед союзом то, который входит в состав составного союза когда...то, ставится запятая.слышны (4) потому что: Перед союзом потому что, который присоединяет придаточное причины, ставится запятая.Таким образом, запятые необходимы в позициях 3 и 4.
Ответ: 3, 4