Приложение - это определение, выраженное существительным, которое согласовывается с определяемым словом в падеже. Обособляются приложения, относящиеся к личному местоимению, а также распространенные приложения, стоящие после определяемого слова.
Разберем каждое предложение:
А. "Его знают как командира строительного отряда." - В данном предложении нет приложения, так как "командира строительного отряда" является частью сказуемого.
Б. "Это был матрос Жухрай." - "Жухрай" является приложением к слову "матрос". Оно стоит после определяемого слова, но не является распространенным. Однако, если имя собственное тесно связано с определяемым словом и является необходимым для понимания, то оно не обособляется. В данном случае, имя "Жухрай" важно для идентификации, поэтому запятая не нужна.
В. "Летчик, простой белобрысый парень, кивнул головой и улыбнулся." - "простой белобрысый парень" - это распространенное приложение, относящееся к слову "летчик". Оно стоит после определяемого слова, поэтому обособляется запятыми.
Г. "Пришел январь месяц крепких морозов." - "месяц крепких морозов" является приложением к слову "январь". Приложение, стоящее после определяемого слова, обычно не обособляется, если только не имеет дополнительного пояснительного значения. Здесь обособления не требуется.
Д. "Врач, Савелий Николаевич, всегда понимал меня с полуслова..." - "Савелий Николаевич" является приложением к слову "врач". Оно стоит после определяемого слова и обычно выделяется запятыми с обеих сторон, если носит характер уточнения.
Таким образом, приложение нужно обособить в предложениях В и Д.
Ответ: В, Д